Δομική Βιοχημεία
Θεωρία: 2 ώρες/εβδομάδα | Εργαστήρια: 2 ώρες/εβδομάδα | Μονάδες ECTS: 5
Μαθησιακά αποτελέσματα
Η ύλη του μαθήματος στοχεύει στην εξοικείωση των φοιτητών με τη δομική βιοχημεία και τις μεθόδους προσδιορισμού και ανάλυσης της δομής των βιομορίων.
Ο φοιτητής με την επιτυχημένη ολοκλήρωση του μαθήματος θα είναι σε θέση να γνωρίζει πληροφορίες σχετικά με:
- τις κύριες κατηγορίες πρωτεϊνικών δομών (τάξης α, τάξης α/β, τάξης β)
- την αναδίπλωση και την ευκαμψία των πρωτεϊνών
- τις βασικές αρχές κρυστάλλωσης των πρωτεϊνών
- την κρυσταλλογραφία ακτίνων Χ (X-ray crystallography)
- τον πυρηνικό μαγνητικό συντονισμό (NMR)
- την ηλεκτρονιακή μικροσκοπία (EM)
- τη διαδικασία επίλυσης και βελτιστοποίησης κρυσταλλικών δομών
Αναλυτικό Περίγραμμα του Μαθήματος
- Δομικοί λίθοι και μοτίβα πρωτεϊνικής δομής
- Πρωτεϊνικές δομές τάξης α
- Πρωτεϊνικές δομές τάξης α/β
- Πρωτεϊνικές δομές τάξης β
- Αναδίπλωση πρωτεϊνών
- Κρυστάλλωση πρωτεϊνών
- Κρυσταλλογραφία ακτίνων Χ: βασικές αρχές και μέθοδοι
- Διαδικασία επίλυσης και βελτιστοποίησης κρυσταλλικών δομών
- Πυρηνικός μαγνητικός συντονισμός
- Ηλεκτρονική μικροσκοπία
Εργαστηριακές Ασκήσεις
- Κρυστάλλωση λυσοζύμης
- Αναζήτηση και ανάλυση ακολουθιών πρωτεϊνών
- Εξοικείωση με τη διεθνή βάση πρωτεϊνικών δομών
- Οικοδόμηση και ανάλυση πρωτεϊνικού μοντέλου
Τρόπος Αξιολόγησης
Η επίδοση στο μάθημα αξιολογείται με α) γραπτές και προφορικές εξετάσεις στο εργαστηριακό κομμάτι του μαθήματος και β) γραπτή εξέταση στο θεωρητικό κομμάτι του μαθήματος κατά την εξεταστική περίοδο. Η επιτυχής επίδοση στις εργαστηριακές εξετάσεις είναι απαραίτητη προϋπόθεση για την κατοχύρωση του βαθμού της θεωρητικής εξέτασης.
Προτεινόμενα Συγγράμματα
- Εισαγωγή στη Δομή των Πρωτεϊνών. Carl Branden & John Tooze.
- Μία μη μαθηματική εισαγωγή στην κρυσταλλογραφία πρωτεϊνών. Νικόλαος Γλυκός
Εκπαιδευτικό Υλικό / E-class
Διδάσκοντες
