Μοριακή Βιοφυσική
ΒΒ0401 | Μονάδες ECTS: 5
Θεωρία: 3 ώρες/εβδομάδα | Εργαστήριo: 2 ώρες/εβδομάδα
Μαθησιακά αποτελέσματα
Στο πλαίσιο των θεωρητικών διαλέξεων οι φοιτητές εξοικειώνονται τόσο με τις φυσικές αρχές που διέπουν την συγκρότηση και λειτουργία των βιολογικών μακρομορίων καθώς και των βιολογικών μεμβρανών, όσο και με τις αρχές των σημαντικότερων βιοφυσικών μεθόδων (θεωρητικών και πειραματικών). Οι θεωρητικές διαλέξεις συμπληρώνονται από τη λύση ασκήσεων και από μια σειρά εργαστηριακών ασκήσεων στις οποίες οι φοιτητές αξιοποιούν τις γνώσεις από τις θεωρητικές διαλέξεις και αποκτούν δεξιότητες στη χρήση πειραματικών και υπολογιστικών μεθόδων και εργαλείων που εφαρμόζονται στη σύγχρονη ερευνητική πρακτική στο πεδίο της Μοριακής Βιοφυσικής.
Αναλυτικό Περίγραμμα του Μαθήματος
- Μοριακές αλληλεπιδράσεις
- Δομή πρωτεϊνών και νουκλεϊκών οξέων
- Μοριακή Θερμοδυναμική
- Μέθοδοι διαχωρισμού και χαρακτηρισμού βιομορίων
- Θερμιδομετρία
- Οπτικές φασματοσκοπικές μέθοδοι ανάλυσης βιολογικών μορίων
- Φασματοσκοπία μάζας
- Φασματοσκοπία NMR
- Φθορισμομετρία
- Κρυστάλλωση βιολογικών μακρομορίων
- Περίθλαση ακτίνων Χ
- Σκέδαση ακτινοβολίας από διάλυμα μακρομορίων
- Κρυο-ηλεκτρονιακή μικροσκοπία
- Μονομοριακές μέθοδοι
Εργαστηριακές ασκήσεις
- Αναζήτηση και ανάλυση ακολουθιών πρωτεϊνών και πρόβλεψη των φυσικοχημικών ιδιοτήτων τους
- Χρωματογραφικός καθαρισμός πρωτεϊνών
- Εξοικείωση με την ανάπτυξη κρυστάλλων πρωτεϊνών
- Βελτίωση πρωτεϊνικού μοντέλου (Refinement) της Ριβονουκλεάσης Α με βάση τον χάρτη ηλεκτρονιακής πυκνότητας από δεδομένα περίθλασης ακτίνων Χ.
Τρόπος Αξιολόγησης
Η θεωρία αξιολογείται με βάση τη γραπτή εξέταση κατά την εξεταστική περίοδο.
Το εργαστηριακό μέρος του μαθήματος αξιολογείται από γραπτή εξέταση μετά το τέλος των εργαστηριακών ασκήσεων και από την αναφορά με τα αποτελέσματα της άσκησης που παραδίδουν οι φοιτητές μία εβδομάδα μετά την κάθε άσκηση. Ο βαθμός του εργαστηριακού μέρους είναι ο μέσος όρος των βαθμών κάθε φοιτητή από τη γραπτή εξέταση και τις αναφορές. Ο τελικός βαθμός του μαθήματος προκύπτει από το βαθμό του θεωρητικού (80%) και του εργαστηριακού μέρους (20%) του μαθήματος.
Προτεινόμενη Βιβλιογραφία
- ΒΙΟΦΥΣΙΚΗ – Αρχές Φυσικής Βιοχημείας, Kensal E van Holde, Curtis, Johnson, Pui Shing Ho, ΕΜΒΡΥΟ, Αθήνα 2010
- Θέματα Μοριακής Βιοφυσικής, Σ. Ι. Χαμόδρακα, Εκδόσεις ΣΥΜΜΕΤΡΙΑ, Αθήνα 1993.
- Molecular Biophysics for the Life Sciences- Norma Allewell, Linda O. Narhi, Ivan Rayment, 2013
Εκπαιδευτικό Υλικό / E-class
Διδάσκοντες
Αναστασία Καντσάδη
(Υπεύθυνη Μαθήματος)
